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OALib Journal期刊
ISSN: 2333-9721
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来自不同地区的两组鼻咽癌活检组织样本共同失调的基因功能及通路

Keywords: 鼻咽癌,生物信息学,基因功能,通路

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摘要:目的探究两组鼻咽癌活检组织样本中差异基因表达谱所显示的失调基因功能及通路的相同之处。方法利用生物信息学的方法分析两组差异表达基因谱,对比其失调的基因功能及通路,同时探索其相同的失调功能与两组数据间相同的基因的关系。结果两样本中显著上调的基因主要与细胞的周期调控、增殖、dna损伤修复、细胞的粘附迁移、代谢及蛋白质结合等相关,但是显著下调的基因无明显的功能聚类;两差异基因表达谱显示出的相同失调基因功能并不是完全由它们的相同基因引起;两者共同失调的通路有10条,排在前4位的为白细胞内皮迁移、细胞粘附分子、粘着斑和磷脂酰肌醇信号系统。结论来自两个不同地区的鼻咽癌活检组织样本的比较发现,其差异表达的基因多与细胞周期调控、dna损伤修复、粘附迁移等相关,这与临床治疗首选放疗的原因相符;通路分析得出4条差异最显著的共同通路也与肿瘤粘附迁移相关,通过干扰其在肿瘤中的病理作用,特别是磷脂酰肌醇信号系统在肿瘤发生、粘附及转移等关键步骤中的信号传导作用,有望提高鼻咽癌的治疗效果及预后。

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