利用agilent定制基因芯片筛选相同病理类型、不同预后的早期乳腺癌的分子标记物

目的分析相同病理类型、临床分期（ⅰ~ⅱ期）但预后不同的乳腺癌组织的基因表达差异，筛选出有意义的基因组合，寻找与乳腺癌预后相关的基因，探索可以早期预测乳腺癌预后的基因分型诊断标准。方法用agilent定制人8×15000芯片对筛选出的实验组8例早期乳腺癌患者的组织标本，结合其预后数据，进行差异基因表达分析；采用real-timepcr技术，在同期收集的验证组42例乳腺癌样本中对差异表达的基因进行验证。结果基因芯片检测分析发现，实验组预后差样本比预后好样本有差异表达基因132个，其中44条基因显著上调，88条基因显著下调（差异均在2倍以上）。结论相同病理类型、临床分期、不同预后的早期乳腺癌组织中基因表达存在显著差异，cd44、mki67、ntrk2、nek2、c16orf60、top2a、ancca、rrm2等8个基因可以作为早期乳腺癌预后预测基因标记物。