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南方医科大学学报 2013
作用于hiv-1gp120小分子hiv进入抑制剂nc-2的虚拟筛选及其作用机制Keywords: hiv-1进入抑制剂,gp120,vrc01,计算机辅助设计,药物筛选 Abstract: 目的基于中和抗体vrc01与hiv-1gp120的结合模式,利用计算机虚拟筛选,从ibs天然产物数据库中筛选靶向hiv-1gp120的小分子hiv-1进入抑制剂,并对其抗病毒活性和机制进行研究。方法运用mm-pbsa方法计算候选化合物与hiv-1gp120结合后自由能的变化;利用hiv-1假病毒、活病毒技术及细胞融合实验,检测化合物抑制hiv-1感染的活性;xtt比色法检测化合物对细胞的毒性;采用酶联免疫吸附测定法(elisa)研究化合物体外抗病毒活性的机理。结果利用计算机从40000个化合物中虚拟筛选出19个与gp120结合后自由能降低较大的小分子化合物,其中nc-2具有抑制hiv-1感染和细胞融合的活性,其抑制hiv-1实验株iiib的ic50是1.95±0.44μmol/l,抑制hiv-1jrfl假病毒的ic50是10.58±0.13μmol/l。酶联免疫吸附法结果表明nc-2体外能抑制hiv-1gp120与cd4的结合,但不抑制hiv-1gp41六螺旋的形成。结论该计算机虚拟筛选的方法可为开发作用于hiv-1gp120的小分子进入抑制剂提供参考。同时,通过计算机辅助设计加病毒活性筛选的方法,得到一个新颖结构的hiv进入抑制剂nc-2。
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