中国人群乙型肝炎病毒基因型间重组的鉴定

目的分析中国乙肝病毒（hbv）的基因型间重组情况，寻找新的重组体。方法下载genbank中所有来自中国的人hbv全基因组序列，运用片段分型法分析筛选hbv疑似重组序列，并利用生物信息学软件simplot鉴定重组事件及重组断点。结果1642条人全长hbv序列中发现755条重组序列，共31种重组体。其中b/c重组体22种676条重组序列；c/d重组体5种75条重组序列；a/c重组体3种3条重组序列；c/i重组体1种1条重组序列。排除已有文献报道的重组类型，总共发现4种共4条重组序列。结论在genbank所有的来自中国地区的hbv全基因组序列中发现31种重组体，其中4种重组体为首次发现，并且c基因型参与中国地区所有的基因型间重组。