增生性瘢痕与正常皮肤组织差异表达基因的筛选与生物信息学分析

目的比较人增生性瘢痕与正常皮肤组织中mrna表达谱的差异，并对差异基因行生物信息分析，从分子水平全面探讨增生性瘢痕的发病机制，为临床治疗提供新靶点。方法收集我院手术切除增生性瘢痕及其邻近正常皮肤组织各3例，采用trizol试剂提取总rna，进行mrna芯片检验，利用genespring10.0软件筛选表达差异基因，并对增生性瘢痕和正常皮肤组间组内行聚类分析，应用davidbioinformaticsresources6.7对差异基因进行基因本体（go）、生物学通路（pathway）分析，获得差异基因相关功能的功能富集类。结果人增生性瘢痕与正常皮肤组织相比较，3例样品重复一次相对表达量比值在2倍以上变化的mrna有6126条，2倍以上上调的mrna共3142条，2倍以上下调的mrna共2984条，5倍以上上调的mrna共28条，5倍以上下调的mrna共44条；重复两次相对表达量比值在2倍以上变化的mrna有6042条，2倍以上上调的mrna共3004条，2倍以上下调的mrna共3038条，5倍以上上调的mrna共25条，5倍以上下调的mrna共38条；其中3例样品都上调的mrna有3832条，2倍以上上调的1920条，2倍以上下调的1912条，5倍以上上调的18条，5倍以上下调29条。cdkn1c，cdkn2a，ctnna3，col6a3，hoxb4等差异表达基因与细胞周期、细胞增殖、以及细胞粘附等生物学过程密切相关，tgfβ1，cdkn1c，cdkn2a，cdc14a，itgb6，egf等差异表达基因主要参与黏着斑形成、b转化因子信号通路、细胞周期信号通路、p53信号通路、肿瘤相关信号通路。结论人增生性瘢痕与正常皮肤组织比较，mrna表达谱发生了明显变化，tgfβ1，smad2，smad7，bax，igf，col1a1，col1a2，mmps，cdc14a，itgb6，egf，cdkn1c，cdkn2a，ctnna3，hoxa3等相关基因参与的生物过程、分子功能、信号通路可能与增生性瘢痕的发生发展密切相关。