中华补血草issr-pcr体系的构建与正交优化
, PP. 93-97
Keywords: 中华补血草,issr,反应体系,正交优化
Abstract:
为获得中华补血草issr的最佳反应体系,采用正交试验设计,对影响issr反应的模板含量、mg2+浓度、dntp浓度、taq酶浓度、扩增程序及退火温度等多种因子进行优化筛选.通过各因子的组合研究,分析非特异性条带的产生原因并进行条件优化,建立了可用于中华补血issr-pcr分析的稳定可靠的反应体系:25μlpcr反应体积,10×buffer2.5μl,2mmol/lmgcl2,dntp100μmol/l,模板dna为20ng,taq聚合酶1.5u,随机引物0.4μmol/l,退火温度52℃~58。所建立的中华补血草issr反应体系具有标记位点清晰、反应系统稳定、检测多态性能力较强、重复性好等特点,可以较好地应用于中华补血草的遗传多样性及物种保护的研究.
References
[1] | 陈炳华,李均,郭巧茹,等.中华补血草多酚提取物对自由基的清除能力[j].植物资源与环境学报,2011,20(3):36-42.
|
[2] | 罗群,马丹炜,王跃华.川乌遗传多样性的issr鉴定[j].中草药,2006,37(10):1554-1557.
|
[3] | 徐红,王燕燕,魏丹红,等.不同产地丹参药材的issr分析与鉴别[j].中药新药与临床药理,2007,18(6):454-457.
|
[4] | kojomam,iidao,makinoy,etal.dnafingerprintingofcannabissativausinginter-simplesequencerepeat(issr)amplification[j].plantamedica,2002,68(1):60-63.
|
[5] | jiansg,shish,zhongy,etal.geneticdiversityamongsouthchinaheritieralittoralisdetectedbyinter-simplesequencerepeats(issr)analysis[j].journalofgeneticsandmolecularbiology,2002,13(14):272-276.
|
[6] | hej,wangh,lidz,etal.geneticdiversityofparispolyphyllavar.yunnanensis,atraditionalchinesemedicinalherb,detectedbyissrmarkers[j].plantamedica,2007,73(12):1316-1321.
|
[7] | gexj,zhanglb,yuanym,etal.stronggeneticdifferentiationoftheeast-himalayanmegacodonstylophorus(gentianaceae)detectedbyinter-simplesequencerepeats(issr)[j].biodiversityandconservation,2005,14(4):849-861.
|
[8] | casasolim,mattionic,cherubini,etal.ageneticlinkagemapofeuropeanchestnu(castaneasativamill.)basedonrapd,issrandisozymemarkers[j].theoreticalandappliedgenetics,2001,102(8):1190-1199.
|
[9] | jiny,zhangwj,fudx,etal.samplingstrategywithinawildsoybeanpopulationbasedonitsgeneticvariationdetectedbyissrmarkers[j].actabotanicasinica,2003,45(8):995-1002.
|
[10] | lihs,chengz.geneticdiversityofsonneratiaalbainchinadetectedbyinter-simplesequencerepeats(issr)analysis[j].actabotanicasinica,2004,46(5):515-521.[15]dieffenbachcw,dvekslergs.pcr技术实验指南[m].北京:科学出版社,2000.
|
[11] | 贺佳,丁小余,褚必海,等.泽泻issr反应体系的建立与优化[j].南京师大学报:自然科学版,2006,29(3):86-90.
|
[12] | linlc,choucj.flavonoidsandphenolicsfromlimoniumsinense[j].plantamedica,2000,66(4):382-383.
|
[13] | 董必慧.江苏沿海滩涂中华补血草的保护性研究[j].中国野生植物资源,2005,24(6):28-30.
|
[14] | zietkiewicze,rafalskia,labudad.genomefingerprintingbysimplesequencerepeats(ssr)-anhoredpolymerasechainreactionamplification[j].genomics,1994,20(2):176-193.
|
[15] | ammirajujss,dholakiabb,santradk,etal.identificationofintersimplesequencerepeat(issr)markersassociatedwithseedsizeinwheat[j].theoreticalandappliedgenetics,2001,102(5):726-732.
|
[16] | 王培训,周联,赖小平.分子生物学技术与中药鉴别[m].广州:世界图书出版社,2002.
|
[17] | 沈洁,丁小余,丁鸽,等.铁皮石斛居群差异的研究ⅱ-issr指纹标记方法的建立与优化[j].中国中药杂志,2006,31(4):291-294.
|
Full-Text