|
南京林业大学学报(自然科学版) 1999
板栗主要栽培品种的分子鉴别及遗传分析DOI: 10.3969/j.jssn.1000-2006.1999.05.020, PP. 89-89 Keywords: 板栗,品种鉴别,rapd分子标记,品种指纹图谱 Abstract: <正>应用rapd分子标记手段,研究板栗品种的遗传多样性,建立了板栗品种rapd标记的标准程序,以及板栗品种的dna指纹数据库,为板栗育种提供理论依据,并为板栗品种鉴别提供了准确、可靠的标准方法,主要结果与结论如下:1?板栗营养体中酚类化合物和单宁物质含量高,dna提取和纯化非常困难。本研究对ctab法加以改良,总结出能够产生扩增产物的模板dna提取和纯化方法。2?建立了稳定的板栗dna扩增反应体系。并对影响rapd反应效果和特异性的两个关键因子,即对退火温度和镁离子浓度进行研究。板栗dna扩增反应体系中,反应体积为20μl。94℃预变性2min,然后执行38个扩增循环,每个循环中,94℃变性30s,72℃延伸90s,最后72℃延伸7min。从s系列的s1~s100共100个引物中筛选出适合板栗基因组dna,能够扩增出稳定产物、扩增谱带清晰、特异性强的16个引物供板栗品种rapd分析用。16个引物扩增的位点总数为119个,特异性多态位点69个,多态位点占总数的58%。3?研究品种间的遗传多样性。46个板栗品种样品的dna,用16个引物进行扩增反应,产生69个多态位点。研究结果表明,各个位点上遗传多样性程度存在较大差别,有效等位基因数目(ne)最大值为1?9990,最小值为1?0444;基因多样度(h)的最大值为0?4998,最小值为0?0425;shannon信息指数的最大值为0?6929,最小值为0?1047。所检测位点的平均有效等位基因数目为1?5260,平均基因多样度为0?3618,平均信息指数为0.8432。有效等位基因数目、平均基因多样度和平均shannon信息指数的标准误都较小,分别为0.3096、0?1418、0?1748,估计精度较高。这三个遗传多样性度量表明板栗品种间具有较高的遗传多样性。品种间遗传距离最大值为0?8001,相应的遗传共享度为0?4493;品种间遗传距离最小值为0?0910,对应的遗传共享度为0?9130。遗传距离是评价品种间近缘关系的良好指标。4?本研究建立了46个板栗品种的dna指纹数据库,并分析出这些板栗品种分子鉴别的最优化引物组合。结果表明,采用16个能产生特异扩增产生的引物中的4个引物,即可准确鉴别所研究的46个板栗品种。分子分类能够有效地揭示形态相似、经济性状相近或部分地理种源相同的品种间的近缘关系。分子标记方法鉴别品种具有广阔的前景。
|