秦川牛gh基因第5外显子的多态性及其与体尺性状的关联性

【目的】研究秦川牛生长激素基因第2外显子的多态性，及其与部分体尺性状指标的相关性。【方法】以502头2周岁左右秦川牛为研究对象，利用pcr-rflp技术检测生长激素基因上存在的单核苷酸多态性（snps），并分析其与秦川牛体尺性状的关联性。【结果】在gh基因第5外显子中发现了2处snps，分别为错义突变和同义突变。位点1经aluⅰ酶切后产生aa、ab和bb3种基因型，a、b等位基因频率分别为0.8257和0.1743；卡方检测显示，该位点在所检测秦川牛群体中处于hardy-weinbery不平衡状态；关联分析表明，该位点不同基因型个体之间在体高、胸围、体斜长和尻长上差异显著。位点2经aflⅱ酶切后产生cc和cd2种基因型，c和d等位基因的频率分别为0.9024和0.0976；卡方检测显示，该位点在所检测秦川牛群体中处于hardy-weinbery不平衡状态；关联分析表明，该位点不同基因型个体间在腰角宽、坐骨端宽和尻长上差异显著。第5外显子2个位点合并基因型分析结果表明，双杂合基因型个体各体尺性状均显著高于其他基因型组合，并且多标记位点的组合效应高于单标记位点。【结论】组合abcd各体尺性状数值均高于ab和cd基因型，组合abcd可能是影响牛体尺性状的最佳基因型组合。