鸽源新城疫病毒陕西分离株p基因的克隆及序列分析

【目的】对鸽源新城疫病毒（ndv）陕西分离株p基因进行克隆和序列分析，为研究p基因及v基因的功能奠定基础，并为防治新城疫提供科学依据。【方法】参考genbank发表的ndv基因序列设计1对特异性引物，rt-pcr扩增ndv/pigeon/shx/china/2003p基因的全长片段，并进行克隆、序列测定和分析。【结果】ndv/pigeon/shx/china/2003p基因全长1451bp，其完整的orf长度为1188bp，编码395个氨基酸。同源性比较可知，ndv/pigeon/shx/china/2003与其他分离株p基因的核苷酸序列同源性在63.6%～92.9%，推导的氨基酸序列同源性在67.7%～92.2%。系统发育进化树表明，ndv/pigeon/shx/china/2003与鸽源分离株p68亲缘关系最近，与f48e9和lasota毒株处于进化树的不同分支。【结论】ndv/pigeon/shx/china/2003与国内外已报道的ndv毒株间存在较大变异。