超甜玉米bt2基因snp位点的分析及分子标记辅助筛选

【目的】利用等位基因特异pcr技术对超甜玉米的基因型进行分子鉴定，建立根据单核苷酸多态性（snp）进行分子标记辅助筛选的平台。【方法】根据超甜玉米基因bt2启动子区域序列设计引物，通过等位基因特异pcr扩增，对pcr产物进行测序，利用clustalx软件，分析比较了32份超甜玉米自交系bt2基因启动子区域的核苷酸序列,并进行了分子鉴定。【结果】在扩增的888bp序列中有3个snp位点，分别在bt2基因转录起始上游的-20，-103和-107bp处，通过对32份超甜玉米自交系的snp位点分析，将其区分为aaa和ggg2种单体型。【结论】利用3个snp位点中的-103（a/g）位点进行等位基因特异pcr，成功地鉴定了超甜玉米自交系的基因型，建立了通过等位基因特异pcr辅助筛选bt2基因的平台。