secy和nusa基因在泡桐丛枝植原体亚组分类中的应用

【目的】利用分子生物学方法分析泡桐丛枝植原体转运蛋白secy基因及转录延伸因子nusa基因，从亚组水平上确定陕西泡桐丛枝植原体的分类地位。【方法】采集陕西杨凌、彬县、旬邑、永寿、周至和宝鸡等6个泡桐栽培区的泡桐丛枝样品，提取病样总核酸；设计引物对secy-f/r和nusa-f/r，对泡桐丛枝植原体secy、nusa基因进行pcr扩增及核苷酸序列测定与系统发育分析。【结果】获得了泡桐丛枝病植原体secy基因序列的全长，大小为1358bp，编码414个氨基酸；获得了部分nusa基因序列，大小为946bp，编码315个氨基酸。序列同源性分析结果表明，陕西各县区泡桐丛枝植原体的secy、nusa基因序列均一致。一致性分析和系统发育分析表明，陕西泡桐丛枝植原体与台湾泡桐丛枝植原体的亲缘关系最近，secy、nusa基因序列的同源性分别为99.9%和99.6%。【结论】首次报道了泡桐丛枝植原体转运蛋白secy基因及转录延伸因子nusa基因的序列，并以其作为分类标准，将陕西泡桐丛枝植原体归属到16srⅰ-d亚组。