ibdv超强毒株和弱毒株vp2基因同义密码子使用偏爱性研究

应用rt-pcr方法扩增并克隆了分离自河南省的30株ibdv超强毒和9株弱毒株vp2基因cdna序列,研究ibdv超强毒和弱毒株的vp2高变区基因不同位点同义密码子的使用情况。结果表明,超强毒株和弱毒株除特定位点的特征性氨基酸不同外,在同义密码子的使用上也有明显的偏爱性。这预示着同义密码子的使用与vp2基因表达及其表达产物的空间结构有关,进而可能影响到ibdv的毒力。