陕西省猪瘟病毒流行毒株e2基因变异分析初报

根据genbank公布的猪瘟病毒(classicalswinefevervirus,csfv)shimen株全基因序列,设计并合成2对引物,用rt-pcr方法对采自陕西省部分地区的30份csf病料中,csfv流行毒株的e2基因进行了扩增,并将其克隆入pmd18-t载体,转化感受态大肠杆菌dh5α。提取pmd-18t-e2重组质粒,进行bamhⅰ、hindⅲ双酶切鉴定,并对阳性质粒进行测序,将测序结果与hclv疫苗株和shimen株e2基因及e2蛋白进行序列分析。结果表明,从30份病料中共扩增到10株csfv流行毒株的e2基因;扩增的10株陕西csfv流行毒株e2基因同源性为92.3%～99.6%,与shimen株及hclv疫苗株的同源性为75.0%～79.4%;10株csfv流行株e2蛋白的同源性为90.0%～100%,与shimen株和hclv疫苗株e2蛋白的同源性分别为78.9%～84.4%和77.8%～83.3%。说明所扩增的10株陕西csfv流行毒株的e2基因发生了较大变异。