1株山东猪瘟病毒流行毒株全基因组的克隆与序列分析

【目的】对分离自山东的猪瘟病毒流行毒株sd02进行全基因组序列克隆分析，揭示sd02分子生物学特征，为猪瘟流行毒株分子流行病学研究积累资料。【方法】根据genbank上发表的古典猪瘟shimen毒株及hclv株全基因序列，参考有关文献合成12对引物，应用rt-pcr技术，从sd02毒株的细胞毒中成功扩增出了11段cdna，将这11段cdna与pmd18-t载体连接并进行克隆、测序，测得的序列经过拼接得到全基因组序列。将sd02与13株参考毒株（39、ald、alfort187、brescia、cap、glentorf、gpe、gxwz02、hclv、lpc、parderborn、riems和shimen）的核苷酸序列及开放阅读框架编码的氨基酸序列进行比较。【结果】拼接后sd02全长12300bp，sd02与13株参考毒株的核苷酸序列同源性为85.4%~99.1%；氨基酸序列同源性为92.5%~98.8%。sd02与我国shimen经典强毒株核苷酸序列同源性高达99.1%，氨基酸序列同源性为98.8%。系统发生树分析表明，sd02与shimen、hclv、riems、glentorf、alfort187、ald等毒株同属于groupⅰ。【结论】sd02毒株在遗传特性和抗原性上仍属于经典毒株。