粘虫核糖体蛋白s11基因cdna的克隆和序列分析

【目的】克隆和鉴定粘虫核糖体蛋白s11（ribosomalproteins11,rps11）基因,为昆虫核糖体蛋白功能的研究提供基础资料。【方法】运用rt-pcr和race技术,以粘虫cdna为模板,对rps11基因进行克隆，获得其全长cdna序列,并利用生物信息学方法,对rps11基因全长cdna序列及推测得到的rps11蛋白氨基酸序列进行分析，构建其系统进化树。【结果】获得的粘虫核糖体蛋白s11基因（rps11）cdna序列长度为521bp，其中包括26bp的5′非编码区、36bp的3′非编码区和459bp的开放阅读框,编码一个由152个氨基酸组成的蛋白,其具有核糖蛋白s17蛋白家族典型特征。推测得到的粘虫rps11蛋白的理论分子质量为17.7379ku,等电点为10.63,富含6种类型的特定功能位点，与同属夜蛾科的烟芽夜蛾（heliothisvirescens）的rps11蛋白相似性高达97%。用neighbor-joining(nj)法构建基于rps11氨基酸序列的系统发育树,结果显示，粘虫rps11与烟芽夜蛾（h.virescens）、草地贪夜蛾（spodopterafrugiperda）和家蚕（bombyxmori）等3种鳞翅目昆虫的亲缘关系较近。【结论】成功获得了粘虫rps11基因全长序列（genbank登录号为gq222274）,由其编码的核糖体蛋白rps11属于核糖蛋白s17蛋白家族。