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ISSN: 2333-9721
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寄生疫霉菌侵染拟南芥相关microrna靶标调控网络分析

, PP. 124-128

Keywords: microrna,生物胁迫,调控网络,go分析

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Abstract:

【目的】分析寄生疫霉菌侵染胁迫下拟南芥表达的microrna,为探明microrna对应靶标基因的调控网络及其可能的病理学和生物学功能奠定基础。【方法】以寄生疫霉菌(phytophthoraparasitica)和模式植物拟南芥(arabidopsisthaliana)为材料,鉴定在病菌侵染胁迫下拟南芥表达的microrna,构建其靶标调控网络,并进行geneontology和蛋白质结构域富集分析。【结果】在寄生疫霉菌侵染拟南芥的solexa测序文库中鉴定39条拟南芥microrna,筛选出了5个转录因子相关的调控网络;geneontology富集结果表明,在生物学过程中,转录调控相关的基因显著富集;蛋白质结构域富集结果表明,靶基因中转录因子显著富集。【结论】拟南芥响应寄生疫霉菌microrna靶标基因的功能主要集中在转录因子的调控功能上。

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