秦川牛chemerin基因第2和第6外显子的snps检测及其与肉质性状的相关性

【目的】对秦川牛chemerin基因第2和第6外显子进行snps检测，并研究其与秦川牛肉质性状的相关性。【方法】采用dna直接测序技术并结合pcr-sscp方法，对324头2～3岁秦川牛chemerin基因第2和第6外显子进行多态性分析，用最小二乘法拟合线性模型对chemerin基因不同基因型与秦川牛肉质性状(宰前活质量、胴体质量、背膘厚、大理石花纹评分、系水力、眼肌面积和嫩度)进行关联分析。【结果】秦川牛chemerin基因第2外显子868bp处发生了a→g突变，第6外显子2948bp处发生了c→g突变；用pcr-sscp方法检测得到aa、ag、gg、ee和ef5种基因型，其基因型频率分别为0.2191，0.4321，0.3488，0.3484和0.6516，均处于中度多态，其中c2948g位点处于hardy-weinberg极度不平衡状态(p＜0.01)。关联分析结果表明，秦川牛chemerin基因第2外显子aa基因型与眼肌面积、背膘厚、大理石花纹评分和系水力均显著相关（p＜0.05）；第6外显子各基因型与供试肉质性状间没有相关性（p＞0.05）。【结论】chemerin基因第2外显子可能是影响秦川牛眼肌面积、系水力和大理石花纹评分等肉质性状的主效qtl或与之紧密连锁，可以尝试将其用作秦川牛品质改良的辅助选择标记。