中国南方部分黄牛品种mtdnad-loop区的遗传变异与分类分析

[目的]检测中国黄牛品种的遗传多样性和遗传亲缘关系.[方法]扩增、测序并分析了8个南方黄牛品种(川南牛、务川牛、温岭牛、隆林牛、湘西牛、郧巴牛、昭通牛、锦江牛)共计40个个体的线粒体d-loop区(mtdnad-loop)全序列.[结果]共检测到56个变异位点,17个单倍型,平均核苷酸差异(k)为20.364,核苷酸多样度(π)为2.25%,单倍型多样度(hd)为0.750士0.074;4种碱基a、t、c、g的频率分别为33.2%,28.2%,25.1%和13.5%;56处多态位点中,转换49处(占多态位点87.5%),颠换4处(占7.14%),缺失/插入3处(占5.36%);在样本数量超过3的群体中,锦江牛和昭通牛分别显示出最贫乏和最丰富的遗传多样性;构建的nj进化树表明,云南昭通牛与其他7个品种的亲缘关系最远.[结论]普通牛较瘤牛具有丰富的遗传多样性,支持普通牛的多地区起源说;云南昭通牛含有不同于印度瘤牛的瘤牛血统,从分子水平上支持云南是潜在的瘤牛起源驯化中心.