|
西北农林科技大学学报(自然科学版) 2009
微卫星dna标记在大口黑鲈亲权鉴定中的应用, PP. 55-62 Keywords: 微卫星,大口黑鲈(micropterus,salmodies),亲权分析,聚类分析 Abstract: [目的]探讨微卫星dna标记在大口黑鲈(micropterussalmoides)亲权鉴定中的可行性,为大口黑鲈家系选育的系谱精确鉴定和选育效果评价提供依据.[方法]选择12个多态信息含量较高的微卫星dna位点,以人工选育建立的大口黑鲈5个全同胞家系为试验材料,采用cervus3.0进行亲权分析,并根据家系内个体间的遗传距离进行upgma聚类分析.[结果]所选的12个微卫星dna多态位点在102个子代中的平均等位基因数(a)为3,平均观测杂合度(ho)为0.5948,平均期望杂合度(he)为0.5457,平均多态信息含量(pic)为0.4759.cervus3.0亲权分析表明,在置信度为95%时,使用12个和10个位点,模拟和实际分析的判别成功率分别为96%和98%,87%和91%;而置信度为99%时,分别为78%和92%,64%和86%;在置信度为99%和95%时,判别准确率皆在90%以上.从12个位点中挑选10个多态信息含量高的微卫星dna位点,即可将102个子代完全准确地聚为5个群体.亲权分析结果与聚类分析结果一致.[结论]所选用的12个微卫星位点可用于大口黑鲈亲权鉴定研究,其判定成功率和准确率较高,结果可靠.
|