猪肉色相关qtl整合定位与基因关联分析

【目的】通过构建整合图谱和meta分析，利用数学模型整合与优化猪肉色相关qtl，分析已知候选基因与“真实”qtl（mqtl）的关联性，为肉色性状的分子标记辅助选择奠定基础。【方法】收集猪肉色相关qtl，包括明度系数（l值，mcolorl）、红度值（a值，mcolora）和黄色度（b值，mcolorb）等指标，利用biomercator2.1软件，将原始qtl映射到美国肉畜研究中心（usda-marc2.0）公布的猪遗传连锁图谱中，构建整合图谱，分析得到qtl簇；对各qtl簇进行meta分析，定位mqtl；进一步将已知候选基因映射到整合图谱，比较候选基因与各mqtl在染色体上的位置关系，分析其关联性。【结果】将176个猪肉色相关qtl进行比对、映射后，构建成新的整合图谱。通过meta分析，将原本分散的qtl定量合并为37个mqtl，其中mqtl2、mqtl3、mqtl8～mqtl11、mqtl13～mqtl16、mqtl18～mqtl20、mqtl24、mqtl25、mqtl29、mqtl31、mqtl32、mqtl35～mqtl37共21个mqtl的缩短比例均超过50%，mqtl9、mqtl19、mqtl11、mqtl28、mqtl35、mqtl8、mqtl2、mqtl3等8个mqtl的置信区间在5cm内。【结论】获得了37个猪肉色性状，图距1.16～22.68cm，较原qtl图距均有不同程度地缩短，缩短比例为25.19%～90.33%，提高了qtl定位的准确度和有效性。