铁皮石斛鲨烯合酶基因的克隆及其组织表达模式分析

【目的】克隆珍稀濒危兰科药用植物铁皮石斛（dendrobiumofficinalekimuraetmigo）鲨烯合酶（squalenesynthase,ss）基因（doss），并对其进行生物信息学与组织表达模式分析，为研究其生物学功能提供参考。【方法】采用rt-pcr和race技术，获得doss基因全长序列；利用生物信息学软件预测doss蛋白的理化性质、结构域及亚细胞定位等分子特性；用dnastar6.0和mega4.0分别进行doss蛋白氨基酸多序列比对和进化关系分析；借助qpcr检测doss基因的组织表达模式。【结果】成功克隆获得铁皮石斛鲨烯合酶基因，命名为doss（genbank注册号jx272631），其cdna全长1735bp，编码一条由410个氨基酸组成的多肽，分子质量46.99ku，等电点7.13；doss蛋白含有鲨烯/八氢番茄红素合成酶保守结构域（44-315位氨基酸）；doss与其他多种植物ss基因的编码蛋白同源性很高（61%～75%），与水稻、玉米等单子叶植物的亲缘关系较近；doss基因为组成型表达，在根中的表达量最大，为叶的12.41倍；茎次之，为叶的1.87倍。【结论】成功克隆得到1个鲨烯合酶基因（doss）全长cdna；doss基因的（在根中高）表达特征暗示，其可能在铁皮石斛根的生长发育中发挥重要的调控功能。