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ISSN: 2333-9721
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小麦条锈菌萌发夏孢子cdna文库中编码分泌蛋白的序列预测

, PP. 105-111

Keywords: 小麦条锈菌,分泌蛋白,信号肽,预测软件

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Abstract:

[目的]植物与病原菌互作过程中,涉及许多可以与植物受体蛋白相互识别、引发植物防卫反应的病原菌激发子或其他致病因子,其中多数为分泌蛋白,深入研究分泌蛋白将有助于明确植物与病原微生物互作的分子机制.[方法]通过signalpv3.0、tmhmmv2.0、targetpv1.1、protcompv6.04个软件,对陕西省农业分子生物学重点实验室构建的小麦条锈菌萌发夏孢子cdna文库中854条est序列进行分泌蛋白预测.[结果]得到具有可溶性分泌信号肽的蛋白编码序列33条,占测定序列的3.86%,其中最小长度为196bp,最大为1096bp,分泌信号肽切割位点基本位于15~42个氨基酸,平均为37个氨基酸.[结论]预测得到的分泌蛋白编码序列,可以作为小麦与条锈菌互作过程中的激发子和致病因子备选基因来进一步研究.

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