福建省猪瘟病毒流行毒株e0基因的克隆与序列分析

[目的]对我国福建省流行的猪瘟病毒e0基因进行序列测定及分析.[方法]应用rt-pcr,从我国福建省送检的54份病料中扩增出14份猪瘟病毒e0基因,将其克隆到t载体上并测序.利用dnastar分析软件,对所测定的14株流行毒株与参考毒株的相应基因片段进行同源性及序列分析.[结果]得到约801bp的猪瘟病毒e0基因片段.序列分析表明,14株福建流行毒株可分为2个基因群,其中fj216与ald、alfort187、brescia、chvri,gpe、glentorf、cap、shimen和hclv等我国主要参考毒株属于基因1群,其他13株流行毒株和我国另一分离株gxwz02属于基因2群.基因1群的fj216与hclv的核苷酸和氨基酸同源性分别为95.0%和94.3%,与shimen的核苷酸和氨基酸同源性分别为99.4%和99.1%;而另外13株流行毒株之间核苷酸和氨基酸同源性分别为89.7%～99.9%和93.84%～99.6%,13株流行毒株与hclv株的核苷酸和氨基酸同源性分别为81.8%～88.1%和86.8%～89.5%,与shimen株的核苷酸和氨基酸同源性分别为83.4%～90.8%和88.6%～93.9%.得到的14株猪瘟病毒ed基因具有rnase活性的2个区域均高度保守,没有发生变异.[结论]福建省近期流行的猪瘟病毒以基因2群为优势毒株,而且大多数与hclv、shimen毒株之间存在较大差异.