野猪源与家猪源prrsv陕西分离株全基因测序与遗传进化分析

【目的】研究野猪源与家猪源猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcinereproductiveandrespiratorysyndromevirus,prrsv)陕西分离株的遗传变异情况及分子生物学特征。【方法】根据vr-2332和hb-1(sh)/2002毒株序列设计引物，对2株prrsv陕西分离毒株shaanxi-1(家猪源)、shaanxi-2(野猪源)全基因分段进行扩增并测序，将测序结果依次拼接得到病毒的全基因，然后进行序列的比对分析。【结果】prrsvshaanxi-1、shaanxi-2毒株高度同源且均属于美洲型毒株，它们与2006年以前分离的毒株相比存在明显差异（与bj-4株的核苷酸同源性仅为89%），而与高致病性prrsv（hp-prrsv）保持较高的同源性（相似率为99%左右）。shaanxi-1、shaanxi2分别呈现不同的变异特点，shaanxi-1orf3、orf5基因变异较大，orf6、orf7较为保守；shaanxi-2orf7基因变异最大，orf3～orf6较为保守。分析发现，shaanxi-1、shaanxi-2具有hp-prrsv的分子特征，但部分位点氨基酸的突变明显区别于hp-prrsv。【结论】不同来源的shaanxi-1、shaanxi-2毒株均属于hp-prrsv演化中的一个分支，但其发生了部分变异，使其具备了新的特点。