猪肌肉组织中apoe基因5′调控区甲基化的研究

【目的】研究猪肌肉组织中猪载脂蛋白e(apolipoproteine,apoe基因5′调控区的dna甲基化状况。【方法】以180日龄长白母猪为试验动物，采集其肌肉组织，提取其dna，经亚硫酸氢盐修饰后用作pcr反应模板;通过生物信息学预测猪apoe5′调控区潜在的cpg岛,根据预测结果选用甲基化特异性引物对cpg岛进行pcr扩增，对回收、纯化的pcr产物进行克隆和测序，并与genbank中的apoe)5′调控区序列进行比对，分析cpg岛的甲基化水平。【结果】生物信息学预测发现，猪apoe基因5′调控区有2个cpg岛，第1个cpg岛有10个cpg位点，第2个cpg岛有12个cpg位点；pcr扩增获得长度分别为233bp的cpg岛1和288bp的cpg岛2序列，这2个cpg岛均存在着9个甲基化cpg位点。【结论】猪apoe基因5′调控区是cpg位点的富集区域，2个cpg岛存在不同程度的甲基化。