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西北农林科技大学学报(自然科学版) 2012
盐芥stz转录因子基因的克隆及序列分析, PP. 215-220 Keywords: 盐芥,c2h2型锌指蛋白,转录因子stz Abstract: 【目的】克隆盐芥stz转录因子基因,对其进行序列分析,为进一步研究thstz转录因子在逆境应答中的作用奠定基础。【方法】利用genbank数据库中盐芥stz转录因子的est序列设计特异引物,通过3′race技术克隆thstz基因的全长序列,应用生物信息学手段对该基因编码蛋白的结构与功能、亚细胞定位等进行预测,并对其编码氨基酸序列的同源性和系统进化进行分析。【结果】盐芥stz转录因子基因全长717bp,编码238个氨基酸。其编码蛋白含有2个c2h2型锌指结构域,位于细胞核内,属于c2h2家族转录因子;多重序列比对和系统进化分析表明,盐芥stz转录因子与拟南芥属植物同源蛋白的相似性最高。【结论】获得了thstz转录因子基因的全长序列,为进一步探讨thstz转录因子在逆境应答中的功能奠定了基础。
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