|
西北农林科技大学学报(自然科学版) 2013
西农萨能奶山羊insig-1编码区的克隆、序列特征分析和组织表达, PP. 24-30 Keywords: 西农萨能奶山羊,胰岛素诱导基因1,实时荧光定量pcr,序列分析,组织表达 Abstract: 【目的】克隆西农萨能奶山羊胰岛素诱导基因1(insig1)编码区,并对其进行序列特征分析和组织表达规律研究。【方法】提取西农萨能奶山羊总rna,反转录cdna后进行pcr反应,对克隆得到的insig-1序列进行生物信息学分析。用实时荧光定量pcr(rt-qpcr)检测insig-1在皮下脂肪、胸部肌肉、乳腺、肝脏、肾脏、心脏、肺、脾脏、瘤胃、小肠10个组织中的表达情况。【结果】获得西农萨能奶山羊insig-1基因1014bp序列(genbank登录号jq665439),其中编码区序列长度为831bp,编码276个氨基酸。西农萨能奶山羊insig-1编码区与牛(genbank登录号nm_001077909)的亲缘关系最近,相似性达97%,编码氨基酸序列的相似性达90%,而与小鼠(genbank登录号nm_025836)的亲缘关系较远。预测insig-1蛋白质分子量为29.70ku,理论等电点为8.99;insig-1蛋白质具有5个跨膜螺旋结构,且有较强的疏水性,不含信号肽。rt-qpcr检测结果表明,在西农萨能奶山羊10个组织中insig-1均有表达,其中在肝脏中的相对表达量最高,皮下脂肪、胸部肌肉、肺次之,在心脏中的相对表达量最低。【结论】克隆得到了西农萨能奶山羊的insig-1基因,并探明了其组织表达规律。
|