荷花遗传多样性的issr标记分析

【目的】探讨荷花（nelumbonuciferagaertn.）资源的遗传多样性和亲缘关系，为荷花资源的保护利用、品种鉴定及育种效率提高提供参考。【方法】利用issr分子标记技术，对6份野生半野生荷花品系和27份荷花栽培品种进行遗传多态性分析，从40条引物中筛选扩增效果较好的5条引物用于试验。采用popgen32软件计算供试材料的等位基因数(na)、有效等位基因数（ne）、nei’s基因多样度（he）和shannon多态性信息指数（i），利用upgma方法进行聚类分析。【结果】用筛选出的5条引物(ubc807、ubc811、ubc836、ubc840、ubc880)分别对33份荷花材料基因组dna进行扩增，共扩增出54条清晰条带，其中多态性条带25条，多态性条带比例为46.3%。应用引物ubc811、ubc840和ubc880的15个特异性位点绘制了33份荷花的dna指纹图谱，这些位点组合后可以将33份荷花材料逐一区分开。33份荷花资源的ne为1.2766，he为0.1920，i为0.3237，且野生半野生品系的各项参数值均低于栽培品种。利用upgma法将供试荷花资源分为4个类群，6个野生半野生荷花品系均在第ⅰ类群，3个中、美杂种莲种系和13个中国莲种系的品种聚在第ⅱ类群，藕莲和花莲分属于第ⅰ类群和第ⅱ类群，第ⅲ和第ⅳ类群分别仅包括1个和2个品种。【结论】供试33份荷花资源的遗传多样性水平较低。聚类结果显示，荷花资源间的亲缘关系与地理分布距离相关，中、美杂种莲种系品种与中国莲种系品种的亲缘关系较近。加强对全国各地荷花资源的调查与保护，是荷花遗传多样性保护的重要工作。