edsvhn03株纤维蛋白基因的克隆与序列分析

[目的]研究减蛋综合征病毒(edsv)河南hn03株纤维蛋白基因全序列,为进一步分析edsv纤维蛋白基因的结构、功能以及edsv基因工程疫苗的研究莫定基础.[方法]根据genbank中收录的edsv纤维蛋白基因序列(z86065),设计并合成了1对引物,pcr扩增edsv河南hn03株纤维蛋白基因.将扩增产物克隆人ptg19-t载体并测序.[结果]测序结果表明,hn03株纤维蛋白基因为1935bp,包含一个完整的开放阅读框,编码644个氨基酸,推导的氨基酸序列有5个潜在的n-糖基化位点,有5个与二硫键形成有关的半胱氨酸.序列分析表明,edsvhn03株与edsv国际标准株av-127纤维蛋白基因核苷酸同源性为99.3%,氨基酸同源性为99.2%;与鹌鹑腺病毒qu株纤维蛋白基因核苷酸同源性为98.9%,氨基酸同源性为98.4%.[结论]腺病毒纤维蛋白基因相当保守.