草鱼bpi/lbp基因的克隆及特征研究

【目的】克隆草鱼杀菌通透性增加蛋白/脂多糖结合蛋白（bactericidalpermeability-increasingprotein/lpsbindingprotein,bpi/lbp）基因的cdna全长，分析其结构特征，研究其表达规律，为进一步探明其功能奠定基础。【方法】首先用同源克隆及快速扩增cdna末端技术(race)，克隆草鱼bpi/lbp基因的cdna全长，然后用生物信息学方法分析bpi/lbp基因的结构特征，最后用半定量rt-pcr检测bpi/lbp基因在草鱼不同组织（血、脑、眼睛、前肠、中肠、后肠、鳔、鳃、头肾、中肾、心脏、肝胰脏、肌肉、皮肤和脾脏）中的表达模式。【结果】草鱼bpi/lbpcdna全长1568bp，编码473个氨基酸，其中包括18个氨基酸组成的信号肽、bpi1结构域（bpi/lbp/cetpn-terminaldomain）和bpi2结构域（bpi/lbp/cetpc-terminaldomain）。该蛋白的分子质量为51551u，等电点为8.69。氨基酸序列同源性分析结果显示，草鱼与鲤鱼bpi/lbp的同源性最高（90%），其次为虹鳟（73%）、斑点叉尾鮰（73%）、香鱼（72%）等。在系统进化树中，草鱼bpi/lbp首先与鲤科的鲤鱼聚为一类。通过半定量rt-pcr分析可知，草鱼bpi/lbp基因在被检测的15个组织中都有表达，其中在鳃中的表达量最高，其次为头肾、中肾等。【结论】成功克隆了草鱼bpi/lbp基因的cdna全长，该基因在草鱼体内不同组织中广泛表达。