兔出血症病毒浙江分离株核衣壳蛋白基因的克隆及遗传变异分析

[目的]探讨兔出血症病毒的遗传变异情况,为兔病毒性出血症的防治提供理论资料.[方法]对1989～2006年7株兔病毒性出血症病毒(rhdv)浙江分离株的核衣壳蛋白基因(vp60)进行了克隆与测序,同时利用分子生物学软件将其与国内外rhdv的基因组序列进行了比对和分析,并绘制了系统发生树.[结果]此7株rhdv的vp60基因均由1740个核苷酸组成,编码580个氨基酸,其与参考序列之间的氨基酸同源性为94.0%～99.8%;系统发生树分析显示,所选的rhdv分离株可分为2个基因群,每个基因群又可分为两个亚群,其中中国分离株主要位于c亚群,与欧洲分离株的遗传距离较近,基因群之间的遗传距离有逐渐加大的趋势.[结论]rhdv在长期流行与演化过程中存在一定的遗传变异趋势.