h9n2禽流感病毒陕西分离株ha基因的遗传变异分析

[目的]对h9n2禽流感病毒ha基因全序列进行分析,了解h9n2禽流感分离毒株ha基因的遗传变异情况.[方法]根据genbank已发表的h9n2毒株的基因序列,设计了2对h9n2禽流感病毒ha基因特异性引物,运用rt-pcr方法对xl、lf和wn分离株进行了扩增,然后将pcr产物送出进行测序,用dnastar5.0软件对测序结果进行了分析.[结果]xl、lf和wn3株h9n2分离株间ha基因的核苷酸同源性为99.7%～99.9%,推导氨基酸的同源性为99.1%～99.6%;分离株与参考毒株ha基因核苷酸的同源性为96.2%～99.0%,推导氨基酸的同源性为96.2%～98.6%.通过对3个h9n2分离株间ha基因核苷酸序列的比较,发现共有5个位点的核苷酸发生突变,其中4个位点核苷酸的改变导致相应的氨基酸发生突变.ha蛋白的7个受体结合位点比较保守,但是其在551～553位缺失了潜在的糖基化位点.[结论]3株h9n2分离株裂解位点氨基酸序列完全符合低致病性禽流感的特征rssr↓g,但是lf裂解位点附近333位脯氨酸(pro)突变为组氨酸(his),即非极性氨基酸向极性带正电氨基酸(碱性氨基酸)转变,裂解位点的变化可能是h9n2禽流感病毒生物学特性改变的分子基础.