新城疫病毒分离株p基因的分子特性和遗传进化

[目的]探讨新城疫病毒(newcastlediseasevirus,ndv)磷蛋白基因(p基因)的分子进化特点,为科学防控新城疫(newcastledisease,nd)提供依据.[方法]对1997～2007年国内分离的13个ndv毒株的p基因进行扩增测序,与15个已发表的国内外不同时期的ndv毒株p基因进行核苷酸和推导的氨基酸遗传变异分析及分子特性研究.[结果]国内ndv分离株p基因核苷酸和p蛋白氨基酸高度同源,同源性分别为93.9%～99.8%和93.4%～99.2%.国内ndv毒株与lasota、clone30和f48e9等p基因核苷酸和p蛋白氨基酸同源性分别为82.2%～87.7%,81.3%～83.8%;与国外毒株则分别为82.1%～90.2%,81.1%～90.7%.氨基酸序列分析表明,我国毒株具有独特的氨基酸位点.分子进化分析表明,ndvp基因中核苷酸同义替代率高于非同义替代率.[结论]国内分离ndv毒株p蛋白遗传距离较近,而与lasota、clone30、f48e9以及国外毒株遗传距离较远,有一定的地域性.ndvp基因以净化选择的方式进化.