团头鲂主要组织相容性复合体ⅰ类基因全长cdna的克隆及组织表达分析

为了解团头鲂mhcⅰ类基因的结构，采用cdna末端快速扩增（rapid-amplificationofcdnaends,race）技术，首次成功克隆了团头鲂“浦江i号”f0基础群体及选育f8世代的mhcⅰ类基因，共获得3条cdna全长序列。序列全长为2040～2079bp，含有87~102bp的5′-utr，1035～1044bp的编码区（包括信号肽，alpha1、alpha2和alpha3三个结构域，跨膜区和胞质区）及911~946bp的3′-utr区，分别编码347、344个氨基酸。f8世代序列的核苷酸/氨基酸的同源性很高，为89.0%/93.0%，而与f0世代的同源性较低（75.3%~77.0%和71.1%~71.4%），呈现出明显的分子多态性。分析表明，团头鲂具有经典的mhcⅰ类分子的空间结构，与人类hla-a2的抗原肽结合区的晶体结构相比，二者的差异主要集中在5个(i~v)区上。在neighbor-joining(nj)法构建的分子进化树中，团头鲂与草鱼的亲缘关系最近，与鲑鳟鱼类、爬行类、鸟类、哺乳类及人类的亲缘关系则渐远。rt-pcr组织表达分析表明，团头鲂mhcⅰ类基因在所检测的的8个组织中均表达，在鳃、头肾和血液中有较强的转录本，中等强度表达于肝脏和脾脏，在后肾、肠和肌肉中表达较弱。