草鱼hepcidin基因cdna克隆、序列分析与表达

运用rt-pcr和快速扩增cdna末端(rapidamplicationofcdnaends,race)技术获得草鱼(ctenopharyngodonidellus)hepcidin基因全长cdna，为774bp，包括orf282bp、5′-utr117bp和3′utr383bp，3′-utr存在1个多聚腺苷酸加尾信号（aataaa）和1个mrna不稳定基序（attta）。推定编码93个氨基酸，与其它鱼类hepcidin的序列同一性为27.9%~51.6%；signalp4.0软件预测信号肽位于1~24位。在邻接(neighborjoining,nj)法构建的系统进化树中，草鱼hepcidin前体肽和其他已报导的鱼类hepcidin前体肽聚为一枝。实时定量pcr(quantitativerealtimepolymerasechainreaction,qpcr）检测结果显示hepcidin基因mrna主要表达于肝脏、脾脏、头肾和眼等组织；柱状黄杆菌注射后4~48h，hepcidin基因在肝脏、脾脏和头肾中表达均显著上调。