稀有白甲鱼西江种群mtdnad环区的结构及遗传多样性

采用pcr扩增和dna直接测序技术，测定分析了采自珠江水系西江的30尾稀有白甲鱼（onychostomarara）mtdnad环约467bp的序列。结果显示，该序列的长度为467~470bp，共计发现了16个变异位点，占分析总位点数的3.40%，其碱基组成a+t的平均含量（67.6%）高于c+t（32.3%）。稀有白甲鱼西江种群mtdnad环区在结构上可分为终止序列区、中央保守区和保守序列区，存在着与终止相关的序列etas以及保守序列csb-f、csb-e、csb-d和csb1。定义了11种单倍型，单倍型多样性指数（hd）为0.7333，单倍型之间平均遗传距离（p）为0.0102，核苷酸多样性（pi）为0.00579，平均核苷酸差异数（k）为2.70575。11个单倍型构建的非加权分组平均法（upgma）系统树聚为2个分支。该研究表明稀有白甲鱼西江种群存在着较丰富的遗传多样性。