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上海海洋大学学报 2012
鲤cyr61基因的克隆、表达及系统进化树的构建, PP. 321-330 Keywords: 鲤,cyr61,克隆,分子系统进化树,半定量rt,pcr,实时荧光定量pcr,基因表达 Abstract: 通过鲤(cyprinuscarpio)基因组序列与斑马鱼(daniorerio)cyr61基因编码区全序列的比对得到了cyr61a、cyr61b和cyr61c共3条序列。分别克隆、测序得到其开放阅读框(openreadingframe,orf)分别是1158bp、1053bp、1107bp,cyr61a和cyr61c得到完整编码区,都是由5个外显子和4个内含子构成,分别编码385、368个氨基酸,其理论等电点值分别是7.83、8.54,分子量(mw值)分别为42.55ku、40.83ku。鲤3个cyr61基因具有高度同源性,并且均含ib、vwc、tsp1、ct4个模块。分子系统学分析表明鲤cyr61基因与其他物种cyr61基因具有高度同源性,且cyr61c与其他高等物种的cyr61同源性更高,利用mega5.0计算出cyr61a、cyr61b和cyr61c的分化时间早于鲤和斑马鱼的物种分化。cyr61c在13个组织中均有表达,在卵巢中表达最高,肠、脑、鳃次之,在其他组织中表达较低且在心脏中表达最低。cyr61a在精巢、肠、鳃中表达较高。cyr61b在精巢和脑中表达最高,肠、肌肉、卵巢次之。实时荧光定量pcr分析cyr613个复制在鲤胚胎发育时期的表达,都是在0h相对表达量最高,显著降低至18h或24h,随后逐渐升高并在6d时下降。
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