罗氏沼虾toll样受体基因cdna片段的克隆及序列分析

提取罗氏沼虾（macrobrachiumrosenbergii）上海养殖群体活体鳃、肌肉、肝胰腺、血液和雄性腺5种组织的总rna；应用rt-pcr技术，从鳃组织中克隆到toll样受体（tlr）基因部分cdna序列，并进行生物信息学分析。基因序列分析表明：所得罗氏沼虾tlr基因cdna序列长1875bp，包含1728bp的开放阅读框，可编码575个氨基酸残基；该部分tlr是一个跨膜蛋白，存在胞外区lrr、lrr-ct、lrr-nt结构域及关键的胞内区tir结构域，具备toll样受体家族的典型结构特征；tir结构域与凡纳滨对虾（litopenaeusvannamei）和日本囊对虾（marsupenaeusjaponicus）、中国明对虾（fenneropenaeuschinensis）、斑节对虾（penaeusmonodon）、中华绒螯蟹（eriocheirsinensis）、拟穴青蟹（scyllaparamamosian）toll样受体基因tir区域的氨基酸序列具有很高的相似性。