亚东鲑基因组中tc1-like转座子的序列歧化特征分析

根据鱼类tc1-like超家族转座子的末端反向重复序列设计单引物，对西藏亚东鲑基因组进行pcr扩增、回收、克隆和测序，鉴定出亚东鲑两条长度为1607bp和1473bp的tc1-like超家族转座子序列，命名为tbt1和tbt2。序列分析表明，亚东鲑tbt1转座子左右两端分别存在一个196nt和225nt的末端反向重复序列（invertedterminalrepeats，itr），在左右itr中分别包含2个12nt的亚末端反向重复序列（sub-terminalinvertedrepeats，sir）；亚东鲑tbt2转座子分别存在一个32nt和31nt短的itr，其左右itr中各仅包含1个12nt的sir。亚东鲑tbt1、tbt2转座子的转座酶编码区在进化过程中各已积累了4个和9个终止突变，两者均不能表达完整的转座酶。亚东鲑tbt2与其它鲑科鱼类tc1-like转座子的相似度低于30%，而与金鱼tca2转座子的序列相似度高达98%，显示该转座子的获得可能起源于基因水平转移（horizontalgenetransfer，hgt）方式。