白斑综合征病毒广西株缺失区基因的比较分析

为了解广西养殖凡纳滨对虾中白斑综合征病毒（whitespotsyndromevirus，wssv）的感染流行情况，并探讨wssv广西株缺失区orf23/24基因的遗传进化差异及其与各地wssv毒株间的遗传进化关系，2010年5月至2013年9月在广西凡纳滨对虾主产区北海、钦州和防城港共采集306份患病虾样品，应用世界动物卫生组织（oie）推荐的套式聚合酶链式反应（nested-pcr）方法进行wssv检测；选取第一轮pcr为阳性的53份样品进行缺失区orf23/24基因的pcr扩增，并将12份阳性pcr产物进行克隆、序列测定与比较分析。结果显示：306份患病虾样品中有82份为wssv感染阳性，阳性率为26.8%；12株wssv广西株缺失区orf23/24基因大小均为2096bp，相对于此区域最为完整的wssv-tw株，广西株均在中间缺失了10970bp；12株wssv广西株的缺失区orf23/24基因差异小，核苷酸同源性均在99.6%以上，仅存在少数碱基的替换，没有缺失和插入，其中bh-3、qz-1、fcg-1和fcg-2的核苷酸序列完全一致；基于缺失区构建的系统发育进化树显示，wssv广西地方株在遗传上相距较近，全部与印度株in-05-ⅰ聚在一个大的分支，而与台湾株、中国株及韩国株在遗传上相距较远。研究表明，wssv感染在广西凡纳滨对虾主要养殖地区存在一定程度的流行；广西wssv毒株缺失区orf23/24基因的变异类型为中间大片段缺失，各毒株间无明显的地域和时间差异；wssv广西株与印度株in-05-ⅰ的遗传进化关系最近。