日本文昌鱼zp蛋白氨基酸序列多样性的初步研究

zp蛋白家族是一类具有相对保守的zp结构域的蛋白质，通常在精卵结合过程中起作用。从日本文昌鱼（branchiostomajaponicum）中发现一种编码927个氨基酸残基的zp蛋白cdna。利用smart预测该zp蛋白序列含有3个结构域：透明带结构域、跨膜结构域以及低复杂度区域。利用该zp基因的整个开放阅读框，检测该基因在日本文昌鱼群体中的氨基酸序列多样性。研究结果发现，在9个日本文昌鱼个体中扩增获得序列长度为2481~2784bp，编码826~927个氨基酸。氨基酸序列比对显示，存在55个变异位点，占总氨基酸残基数的5.93%（55/927），其中有2个个体的氨基酸序列分别存在9个和101个氨基酸残基的缺失，这可能与zp基因的不同剪切有关。揭示了日本文昌鱼zp蛋白序列多样性可能与该蛋白的结构与功能多样性具有一定的相关性。