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生物工程学报 2006
快速老化小鼠海马差异表达cdna芯片的制作Keywords: 老年性痴呆,cdna芯片,差异表达,实时定量rt-pcr,快速老化小鼠 Abstract: 老年性痴呆(alzheimer'sdisease,ad)是老年人群中最普遍的痴呆类型,是一种神经退行性紊乱疾病,目前临床上还没有有效的治疗方法。快速老化小鼠亚系p8(senescenceacceleratedmouseprone8,samp8)是研究增龄相关性认知缺陷机制以及研究脑老化机制的良好动物,同时也是研究ad较为理想的实验动物模型之一。cdna芯片技术可以同时规模研究成千上万个基因的表达,尤其适于ad这种多机制、多靶标、多途径的复杂疾病的研究,为了揭示ad的发病机制,发现用于治疗ad的药物靶标,以samp8和samr1海马抑制消减cdna文库中的cdna片段为材料,以β-actin和g3pdh为内参,设计了16×(14×14)点阵方案,并点制了含有3136个点的sam海马差异表达cdna芯片。芯片背景均匀一致,点的大小均一,排列规则整齐。在靶分子与探针杂交过程中,进行了杂交条件和洗涤芯片的优化。将杂交结果进行统计分析,选择差异表达的cdna进行测序并进行生物信息学分析,用实时定量rt-pcr对部分基因的表达进行了验证,检测了芯片筛选结果的可靠性。该芯片的成功制备为进一步进行差异表达基因的筛选和研究提供了良好的手段,并将成为揭示samp8脑老化和ad发病机制的有力手段。
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