克氏肺炎杆菌nife-氢酶基因的克隆与序列分析

采用clustal-w软件对swiss-prot蛋白数据库中已报道的nife-氢酶大亚基氨基酸序列进行比对分析，找到保守区并根据此设计兼并引物。利用其中一对引物进行pcr得到一条大小约为1000bp的dna序列，并根据此序列设计引物进行反向pcr得到整个nife-氢酶的序列。再利用生物信息学软件对此氢酶的序列进行二、三级结构预测及大小亚基的对接（docking）。结果表明克氏肺炎杆菌的nife-氢酶属于一类膜结合放氢酶（ech氢酶）。