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ISSN: 2333-9721
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属级芯片筛查技术在马铃薯纺锤块茎类病毒属检测中的应用

DOI: 10.13345/j.cjb.130329, PP. 514-523

Keywords: 马铃薯纺锤块茎类病毒属,属级探针,芯片,菊花矮化类病毒,番茄雄性株类病毒

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Abstract:

建立马铃薯纺锤块茎类病毒属(pospiviroid)类病毒有效的芯片筛查技术,对该属类病毒进行筛查。分析了该属类病毒序列,得到19条具有属级鉴定特征的探针。这些探针符合gc含量在40%与60%之间、单个核苷酸含量不大于50%、无多于4个核苷酸的连续重复及不形成多于6个核苷酸的发卡结构的标准;将探针点制到玻璃片基上制备芯片。芯片探针有效性实验结果表明,菊花矮化类病毒(chrysanthemumstuntviroid,csvd)及番茄雄性株类病毒(tomatoplantamachoviroid,tpmvd)样品杂交可获得有效信号;灵敏度实验结果表明,该芯片可检测到200pg/μl的总rna。该芯片可用于pospiviroid类病毒的筛查。

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