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生物工程学报 2006
rep-pcr应用于快速鉴定啤酒污染菌的研究Keywords: rep-pcr,boxa1r,(gtg)-5,相似系数阈值,啤酒腐败菌 Abstract: 为评价rep-pcr在快速鉴定啤酒污染菌中的应用,首先比较了dna提取方法,确定ctab法作为制备rep-pcr的dna模板的方法。并通过pcr产物直接测序的方法,从分离菌中鉴定得到11种常见的啤酒污染菌。用boxa1r和(gtg)5引物扩增分离菌,采用gelcomparⅱ软件处理电泳图,构建污染菌的标准指纹图库。经过聚类分析表明,boxa1r和(gtg)5对lactobacillusbrevis、l.buchneri、l.casei/paracasei、l.plantarum和l.fermentum的聚类效果具有互补性,并首次提出指纹比对快速鉴定的相似系数阈值的概念。对来自三个不同来源的9株乳酸菌的快速鉴定结果表明,rep-pcr鉴定技术简单、快速、可靠,在快速鉴定方面将具有重要的应用价值。
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