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ISSN: 2333-9721
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金黄色葡萄球菌特异性pcr检测靶点的自动化筛选

, PP. 637-644

Keywords: 金黄色葡萄球菌,基因组,生物信息比对分析,编码序列,c++编程

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Abstract:

旨在挖掘用于鉴定金黄色葡萄球菌的高特异性靶点及其pcr检测引物。采用c++语言编程,以金黄色葡萄球菌staphylococcusaureusmrsa252基因组编码序列为对象,对2656个可编码区进行分析,获得特异性靶点序列,并设计pcr扩增引物。对包括葡萄球菌属11个种及其他细菌属在内的共计137株细菌验证引物特异性,筛选获得9个dna序列,并设计了4对引物。经验证2对引物的特异性较好,其中引物sa3的基因组dna检测限为13.7fg/μl,菌体检测限为9.25×102cfu/ml。结果验证

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