基于功能域组分的蛋白质折叠类型识别

蛋白质空间结构研究是分子生物学、细胞生物学、生物化学以及药物设计等领域的重要课题．折叠类型反映了蛋白质核心结构的拓扑模式，对折叠类型的识别是蛋白质序列与结构关系研究的重要内容．选取lifca数据库中样本量较大的53种折叠类型，应用功能域组分方法进行折叠识别．将astral1.65中序列一致性小于95%的样本作为检验集，全库检验结果中平均敏感性为96.42%，特异性为99.91%，马修相关系数(mcc)为0.91，各项统计结果表明：功能域组分方法可以很好地应用在蛋白质折叠识别中，lifca相对简单的分类规则可以很好地集中蛋白质的大部分功能特性，反映了结构与功能的对应关系．