go功能类与基因差异表达的关联规则挖掘算法

针对基因功能分类体系geneontology的层次结构特点，修改关联规则挖掘算法apriori，开发“挖掘与基因差异表达关联的go功能组合”软件(rulego).rulego以基因表达谱上的差异表达基因集合和不差异表达基因集合为输入，输出组合特征功能类与基因差异表达现象的关联规则，有助于解释基因差异表达现象的本质原因，如疾病发病机制、药物作用机理等.将rulego和ontoexpress应用在结肠癌和腺癌表达谱数据集上，结果显示,rulego比ontoexpress能发现更多的与差异表达现象关联的特征功能类，更能看到在ontoexpress上不能发现的组合特征功能类.另外，结果显示,将规则的置信度和支持度要求设置较高时，一般只有组合功能类才能满足要求，这提示在基因表达谱分析中不宜采用单个角度的单个功能分类单元，考虑功能分类单元的组合可能更有意义.