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ISSN: 2333-9721
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多样性指标用于基因中剪切位点的识别

Keywords: 剪切位点,多样性增量,二次判别法,外显子,内含子

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Abstract:

根据基因剪切位点处的碱基保守性特征,和附近位点的碱基组成和关联特征,应用多样性指标和二次判别分析,对几类模式生物的基因结构进行统一的分析和预测,能够较好地识别外显子和内含子及其边界.计算结果表明,对于4类物种,线虫(c.elegans),拟南芥(a.thaliana),果蝇(d.melanogaster)和人类(human),核苷酸水平的识别精度为92.5%~97.1%,外显子水平的识别敏感性为83.7%~94.5%,特异性为87.8%~97.1%.预测能力优于genesplicer等剪切位点检测软件.

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