蚊子全基因组中微卫星的丰度及其分布

微卫星是近年大力开发的一种遗传标记，为推进按蚊遗传学相关研究，对按蚊全基因组中由1~6个碱基重复单元组成的简单序列重复(微卫星)进行了分析.进而对其微卫星的丰度和分布进行了比较分析，也比较了染色体各个区域(外显子、内含子和基因间隔区)之间的分布差异.微卫星在按蚊基因组中的比例约占2.14%，其中x染色体拥有微卫星的密度最大.对按蚊基因组中微卫星丰度而言，a碱基和c碱基重复在基因组中丰度相似，ac单元的丰度是ag单元的两倍多，然而at和cg单元非常稀少；对于三四碱基而言，agc，aaac和aaat单元最为丰富，acg，act，agg，ccg，atgc，cccg，actg，aact，acgt，agat，ccgg，acct和agct单元等均很稀少，而一些五碱基重复，在某条甚至某几条染色体中均未分布.除两碱基重复单元在2l的外显子区域丰度较高外，其他重复单元均在内含子和基因间隔区丰富.进一步分析显示，微卫星在每条染色体两臂的丰度和分布存在着很多的相似性.